בשנים שלאחר המלחמה חזרו יהודים להתיישב בקובנה, חלק מהם חזרו ממחנות הריכוז בגרמניה וחלק מהחוזרים היו מהגולים לברית המועצות. מיד לאחר שחרור קובנה ע"י הצבא האדום התחילה בליטא תנועה רבתי של עלייה לארץ ישראל, במטרה לעזוב את הארץ שהפכה לבית קברות גדול. כ-80 ילדים שהוסתרו בזמן השלטון הנאצי אצל ליטאים, הוחזרו לקובנה ונקלטו ב"בית ילדים" יהודי שהוקם בעיר, ב- 1959 התפקדו בקובנה 4792 יהודים, בשנת 1970 – 4157 יהודים, בשנת 1989 ירד מספרם ל-1359, ובשנת 1992 נותרו 600 יהודים בלבד. במשך כל שנות השלטון הסובייטי לא התקיימה כל פעילות יהודית, לקראת סוף שנות ה-80 הוקם בקובנה סניף של מרכז התרבות היהודית. בתחילת שנות ה-90 הוקמה גדר סביב בית הקברות שעל ההר הירוק, אנדרטאות הוקמו בפורט התשיעי ובפורט הרביעי ושלטי זיכרון הוצבו בסלובודקה.
פרטים על הקהילה היהודית בקובנה:
יו"ר הקהילה: גרטסאס זקס - Gertsas Zhakas
כתובת: Gedimino St.26b Kaunas LT-44319 Lithuania
טלפון: 717 203 37 370+, פקס: 135 201 37 370+
e-mail: kzb@pub.vdu.lt
ספרים להרחבה:
פנקס הקהילות – ליטא, עורך דב לוין, ירושלים תשנ"ו ליפמאן ד.מ. לתולדות היהודים בקובנה וסלבודקה, קיידן תרצ"א גיברלטר,יצחק אלחנן, יסור יסרני, בני ברק תשס"ז גוטלובר א"ב, זכרונות ומסעות, ירושלים תשל"ו ליפץ דב, קובנה, ביהדות ליטא, ג', ת"א תשכ"ז לוין דב, בין ניצוץ לשלהבת, רמת גן תשמ"ז נשמית, הילדים מרחוב מאפו, ת"א תשכ"ב גולדברג לאה, פרקי זכרונות מקוטעים, ההיכל ששקע – החינוך העברי בקובנה, מוסדות ואישים, ת"א 1962. רובינשטיין ראובן, ספר אברהם רובינשטיין, ת"א תשל"א שורץ דוד מרדכי, קורות חיי, ת"א תש"ט רפפורט,יהודיה גזעית- בין שם לכאן, קובנה וארץ ישראל, ירושלים 2004 ספרים בנושא השואה: גרופנקל לייב, קובנה היהודית בחורבנה, ירושלים תשי"ט אילתי שלום, לחצות את הנהר, ירושלים תש"ס ילין מאיר, מעטים שעזרו הרבה, ביהדות ליטא ד',ת"א תשמ"ד 131 ילדי גטו קובנה ,ראה: סופי בן ארצי, אחד מכולם, הוצאת הקיבוץ המאוחד - ספריית הפועלים. ספרי הרחבה על ר' יצחק אלחנן ספקטור: ליפשיץ יעקב הלוי, ספר תולדות יצחק, וורשא, תרנ"ז שימוץ א', ר' יצחק אלחנן ספעקטאר, ניו יורק, תשכ"א אשרי אפרים,ספר שאלות ותשובות ממעמקים א', ניו יורק תשי"ט אשרי אפרים, ספר שאלות ותשובות ממעמקים ב', ניו יורק תשכ"ג
מנקוביץ זאב, היכון לקראת חירות, רשימות מגטו קובנה וממחנה קאופרינג , הוצאת יד ושם